הרב יאשיהו פינטו ביקש להשתחרר ממאסר נוכח מצבו הרפואי הירוד אך הוועדה דחתה את בקשתו. הרב החל לרצות בחודש שעבר את שנת המאסר שנגזרה עליו בעקבות הרשעתו בשיבוש מהלכי משפט, במתן שוחד ובהצעה לשוחד לתת-ניצב אפרים ברכה שהיה ראש היחידה הארצית לחקירות הונאה. פרטים מפרוטוקול דיון הוועדה מגלים כי במהלכו קשרה המדינה לראשונה בין התאבדות ברכה לפרשת פינטו. בתגובה, הגישו עורכי דינו של פינטו תלונה נגד פרקליט המדינה, שי ניצן.
עו"ד איריס פיקר מפרקליטות מחוז מרכז טענה כי יש לדחות את בקשת הרב פינטו משום ש"יש לקחת בחשבון את עמדתם של נפגעי עבירה". אותם הנפגעים, לדבריה, הם בני משפחתו של אפרים ברכה "שהתאבד בעקבות הפרשה האומללה". מוקדם יותר בדיון ציינה פיקר: "אנחנו הולכים לסעיף נוסף – שיקולים של טובת הציבור, לרבות שלום משפחתו של האסור ושלום נפגע העבירה ומשפחתו. גם את זה אנחנו צריכים לשקול". אלא שמעולם לא נמצאה תשתית ראייתית או עובדתית הקושרת את הרב פינטו להתאבדות ברכה. בעקבות כך, פרקליטיו של הרב, עו"ד יובל יועז ועו"ד רותם טובול, פנו ליועץ המשפטי לממשלה אביחי מנדלבליט בטענה כי למרשם אין קשר להתאבדותו של ברכה.
עו"ד של הרב ביקשו כי הפרקליטות תחזור בה מאמירותיה בוועדה, שלדבריהם ייתכן והשפיעו על ההחלטה לדחות את בקשת הרב. "תת-ניצב ברכה בחר לשים קץ לחייו, בנסיבות שאנו תקווה שייחקרו עד תום בידי הרשויות המוסמכות", כתבו. "מרשנו, כמו כל אדם אחר החי בינינו, אינו נושא באחראיות למותו של תת-ניצב ברכה. הפניית אצבע מאשימה באופן כה מכוער כלפי מרשנו, במסגרת דיון בפני מותב שיפוטי, מהווה חציית קווים אדומים מצד התביעה הכללית בהתנהלותה כלפי מרשנו". עד כה פנייתם לא זכתה למענה, אך במהלך דיון בערעור שהגיש פינטו לבית המשפט המחוזי מרכז נגד החלטת ועדת השחרורים, הגיעה הצהרה מטעם נציג הפרקליטות עו"ד גיא אברס, שבה חזר מדבריה של פיקר. במהלך הדיון טען אברס מפרקליטות מחוז מרכז כי הדברים לא השפיעו על החלטת הוועדה.
"אנו מבקשים להצהיר שאין בידנו תשתית ראייתית משפטית שבכוחה לבסס קשר סיבתי בין הפרשיה לבין התאבדותו המצערת של תת ניצב אפרים ברכה", אמר עו"ד אברס. "בנסיבות אלה, מוטב היה שהדברים לא ייאמרו. עשינו בירור בעניין והתברר שנעשתה טעות בתום לב". עם זאת, ציין אברס, "יש קביעה של בית המשפט לגבי יחסי המרות בין העותר לבין אפרים ברכה והעובדה שהסמכות היא רוחנית, אין בה כדי לבסס את הטענה".
פרקליטי הרב פינטו ראו בתשובתו של עו"ד אברס "אמירה מקוממת", זאת משום שרמז שוב לקשר בין התאבדות ברכה לפרשת הרב פינטו. בשל כך, הם הגישו תלונה לשופטת (בדימוס) הילה גרסטל, נציבת הביקורת על הפרקליטות, נגד פרקליט המדינה שי ניצן. "אמירה זו מקוממת אף יותר מדבריה המופקרים של עו"ד פיקר", כתבו, "שכן זו הפעם דברי נציג הפרקליטות נאמרו – על פי דבריו שלו – לאחר שיקול דעת שנעשה בצמרת הפרקליטות והם משקפים את עמדת המערכת".
