מממצאי התחקיר עולה הערכה כי בסבירות גבוהה השלושה נהרגו מתוצר לוואי של תקיפה אווירית של צה״ל, במהלך חיסולו של מפקד החטיבה הצפונית של החמאס, אחמד ע׳נדור, ב-10 בנובמבר 2023. מדובר בהערכה בסבירות גבוהה נוכח כלל הנתונים, אך לא ניתן לקבוע בוודאות את נסיבות מותם. קביעה זו מבוססת על מיקום מציאת גופותיהם ביחס לפגיעת התקיפה, חקר ביצועים של התקיפה, ממצאי מודיעין, תוצאות הדו״חות הפתולוגיים וכן קביעת המכון לרפואה משפטית.
מהתחקיר עולה כי שלושת החטופים הוחזקו במתחם המנהרות ממנו פעל ע׳נדור. בעת התקיפה לא היה בידי צה״ל מידע על הימצאות חטופים במתחם שהותקף, ויתרה מכך, היה מידע שהצביע על מיקומם במקום אחר, ולכן המרחב לא הוגדר כאזור שבו יש חשד לנוכחות חטופים. לאורך כל המלחמה, צה"ל לא תוקף במרחבים בהם יש אינדיקציות או חשד להמצאות חטופים. צה״ל מפעיל מנגנון של מפקדת השבויים והנעדרים באגף המודיעין, שמטרתו לוודא שהפעולות ההתקפיות אינן פוגעות בחטופים ככל הניתן, ומשקיע מאמצים גדולים בהבאת מידע אודות החטופים.
גופותיהם של שלושת החטופים חולצו מהמנהרה שבה שהה ע׳נדור ב-14 בדצמבר, בעקבות מידע מודיעיני והם הובאו לקבורה בישראל. צה״ל משתתף בצערן של המשפחות על האובדן הקשה וימשיך ללוותן.
מצה״ל נמסר: "צה"ל ממשיך גם בשעה זו, לפעול בכלל המאמצים על מנת לממש את המשימה הלאומית העליונה להשבת כל החטופים".